10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0375 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1003  hypothetical protein  98.37 
 
 		 123 aa  236  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0255  hypothetical protein  31.5 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1234  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  30.25 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2738  hypothetical protein  26.79 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1316  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2411  hypothetical protein  32.46 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>