35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1801 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 362 aa  745    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.02 
 
 		 347 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  41.02 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  40.79 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  39.26 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.51 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.68 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.57 
 
 		 392 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.31 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  36.86 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.31 
 
 		 334 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.14 
 
 		 359 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  36.21 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  32.73 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  33.55 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  28.74 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  34.15 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  31.62 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  28.92 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  33.9 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  26.23 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  23.36 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.44 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  24.37 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  25.54 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.74 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.28 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  23.92 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.92 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  22.7 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.57 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  23.68 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>