26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2788 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  983    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  60 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  50.41 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  49.34 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  48.86 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  48.56 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  48.32 
 
 		 467 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  46.48 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  40.22 
 
 		 510 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  42.73 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  37.3 
 
 		 498 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  37.04 
 
 		 474 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  35.98 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  32.84 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  35.31 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  33.46 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  25.38 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  28.16 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  26.83 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  22.93 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  26.84 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.159501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  23.42 
 
 		 552 aa  50.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  25.94 
 
 		 432 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  22.07 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  23.86 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  27.85 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>