218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1675 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  41.44 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  40.55 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  40.07 
 
 
316 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  36.73 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  36.39 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  38.7 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  40.26 
 
 
316 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  31.85 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  29 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  31.05 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.54 
 
 
297 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.54 
 
 
297 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  27.21 
 
 
297 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  26.89 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  26.89 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  26.89 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  26.89 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.89 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  27.21 
 
 
297 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  26.23 
 
 
297 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  27.36 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  26.67 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.27 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  32.35 
 
 
333 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  28.53 
 
 
302 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
303 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5480  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 
304 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142715  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3978  hypothetical protein  29.19 
 
 
321 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000353238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
297 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  26.37 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  25.74 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  28.51 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4741  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  30.67 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
290 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.57 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  28.57 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  27.72 
 
 
321 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  28.57 
 
 
321 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0277  hypothetical protein  27.52 
 
 
321 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000163126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0203  hypothetical protein  28.05 
 
 
321 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000250844  decreased coverage  0.00000260823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  35.02 
 
 
294 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2664  cell division protein FtsX  25.7 
 
 
304 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.131472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
296 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  28.46 
 
 
311 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0221  hypothetical protein  27.91 
 
 
321 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.114522  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1800  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
294 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00238139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
296 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3604  hypothetical protein  27.45 
 
 
321 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  28.25 
 
 
321 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2195  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 
296 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000249037  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3503  hypothetical protein  27.18 
 
 
321 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  25.99 
 
 
326 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3466  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  28.24 
 
 
321 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.486455  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
321 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  27.92 
 
 
321 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  27.56 
 
 
351 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0291  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000447855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  30.22 
 
 
301 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
301 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  31.02 
 
 
317 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  28 
 
 
351 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  28 
 
 
351 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  28 
 
 
351 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  28 
 
 
351 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
301 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  28.89 
 
 
295 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  28.03 
 
 
317 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
301 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  28.03 
 
 
317 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  27.92 
 
 
321 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  28.03 
 
 
317 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1059  cell division protein FtsX  25.24 
 
 
311 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  27.56 
 
 
351 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3003  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
297 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00163354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1883  protein of unknown function DUF214  28.25 
 
 
290 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.44 
 
 
321 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  28.06 
 
 
302 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
296 aa  99  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  29.33 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0701  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  27.15 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0625  cell division ABC transporter component permease protein FtsX  27.62 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.910778  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  27.8 
 
 
324 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1454  Cell division protein-like protein  25.08 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.805507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  28.62 
 
 
341 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>