20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0249 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0249  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  34.12 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  32.56 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 804 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  36.84 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 817 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 817 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 814 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  28.38 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  29.31 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  41.67 
 
 		 441 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 778 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  42 
 
 		 807 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  32.43 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  25.97 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>