33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1962 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  53.51 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  61.26 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  60.38 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  39.81 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  43.93 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  35.96 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  30 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  33.67 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  36.17 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  26.92 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  30.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.96 
 
 		 356 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  30.61 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.96 
 
 		 356 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  31.63 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  30.93 
 
 		 356 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  30.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  37.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  31.36 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.32 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  34.75 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  32.99 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  35.09 
 
 		 146 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>