11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1783 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1783  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000128994 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1683  hypothetical protein  78.63 
 
 
278 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269459  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1595  hypothetical protein  75.19 
 
 
265 aa  422  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0512  hypothetical protein  74.05 
 
 
265 aa  418  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0639953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  25.7 
 
 
379 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  35.51 
 
 
392 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  33.33 
 
 
850 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  29.36 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  29.36 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  23.26 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.792698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>