46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1300 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1300  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  353  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1416  PaREP1 domain-containing protein  58.86 
 
 
166 aa  159  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0121  PaREP1 family protein  48.15 
 
 
173 aa  148  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1348  PaREP1 domain-containing protein  54.61 
 
 
171 aa  142  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  44.79 
 
 
180 aa  141  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1316  PaREP1 domain-containing protein  46.43 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16604  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  44.03 
 
 
167 aa  134  9e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1132  PaREP1 domain-containing protein  47.3 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.252197  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  48.92 
 
 
175 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  41.1 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0950  PaREP1 domain-containing protein  45.86 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  43.62 
 
 
166 aa  112  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  40.62 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  44.94 
 
 
156 aa  105  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  47.37 
 
 
158 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2014  PaREP1 domain-containing protein  43.95 
 
 
186 aa  100  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00133149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  43.62 
 
 
162 aa  100  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  48.12 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0934  PaREP1 domain-containing protein  51.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000142173  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0469  PaREP1 family protein  38.93 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0206869  hitchhiker  0.000000022653 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0238  PaREP1 domain-containing protein  42.36 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.189081 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  34.84 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1430  PaREP1 domain-containing protein  40.74 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0697569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  38.89 
 
 
160 aa  84.3  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1514  PaREP1 domain-containing protein  37.58 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  normal  0.593103 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0508  PaREP1 family protein  40.41 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973626 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0229  PaREP1 family protein  38.67 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.529373  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  37.96 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0369  PaREP1 domain-containing protein  37.33 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0859081  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  35.95 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1474  PaREP1 domain-containing protein  40.82 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  39.37 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  34.64 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  34.67 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  34.19 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0255  PaREP1 domain-containing protein  35.29 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0372  PaREP1 domain-containing protein  34.21 
 
 
187 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295091  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  34.67 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  34.9 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1691  PaREP1 protein  32.2 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.346132  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0363  PaREP1 domain-containing protein  34.92 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0334  PaREP1 domain-containing protein  34.92 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  35.94 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  35.29 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  34.68 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0129  PaREP1 domain-containing protein  47.06 
 
 
119 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>