12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0730 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0730  cytochrome c-type biogenesis protein (CcdA)  100 
 
 		 340 aa  660    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000473312 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.94 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0674  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0540  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.69 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1482  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.07 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0634  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.05 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0779825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0929  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.11 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.505775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1726  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.23 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.78327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  45.83 
 
 		 649 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  43.75 
 
 		 615 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  43.75 
 
 		 615 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  43.75 
 
 		 615 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>