11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0503 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0503  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0766  hypothetical protein  71.79 
 
 
118 aa  184  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0712  hypothetical protein  70.09 
 
 
118 aa  179  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.286492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1750  hypothetical protein  67.52 
 
 
118 aa  178  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  37.74 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  35.83 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  31.19 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  30.88 
 
 
161 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  26.72 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>