45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0255 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0255  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  350  4e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0464  PaREP1 domain-containing protein  78.89 
 
 
184 aa  255  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0695  PaREP1 domain-containing protein  82.22 
 
 
181 aa  246  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000720925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0257  PaREP1 domain-containing protein  78.33 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0229  PaREP1 family protein  63.07 
 
 
182 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.529373  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0469  PaREP1 family protein  65.7 
 
 
190 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0206869  hitchhiker  0.000000022653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0076  PaREP1 domain-containing protein  74.01 
 
 
183 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.470948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0403  PaREP1 domain-containing protein  69.49 
 
 
181 aa  218  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1514  PaREP1 domain-containing protein  63.64 
 
 
188 aa  216  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.121861  normal  0.593103 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0473  PaREP1 family protein  64.88 
 
 
209 aa  209  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.0000000291135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1430  PaREP1 domain-containing protein  63.1 
 
 
183 aa  207  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0697569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0334  PaREP1 domain-containing protein  67.63 
 
 
184 aa  206  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0491  PaREP1 domain-containing protein  76.19 
 
 
179 aa  206  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.971413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0363  PaREP1 domain-containing protein  67.63 
 
 
184 aa  206  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0369  PaREP1 domain-containing protein  63.28 
 
 
182 aa  204  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0859081  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0258  PaREP1 domain-containing protein  72.67 
 
 
164 aa  193  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0372  PaREP1 domain-containing protein  63.64 
 
 
187 aa  188  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295091  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0849  PaREP1 domain-containing protein  67.61 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162193  normal  0.415152 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1474  PaREP1 domain-containing protein  64.29 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0508  PaREP1 family protein  60.71 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0321  PaREP1 domain-containing protein  66 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1544  PaREP1 domain-containing protein  45.39 
 
 
167 aa  111  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1463  PaREP1 domain-containing protein  44.52 
 
 
180 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2014  PaREP1 domain-containing protein  40.12 
 
 
186 aa  104  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00133149 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0390  PaREP1 domain-containing protein  43.67 
 
 
161 aa  99  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0555  PaREP1 domain-containing protein  42.68 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000150725  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1316  PaREP1 domain-containing protein  40 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16604  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0238  PaREP1 domain-containing protein  41.95 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.904061  normal  0.189081 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0116  PaREP1 domain-containing protein  39.38 
 
 
166 aa  89  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.441984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0129  PaREP1 domain-containing protein  72.88 
 
 
119 aa  89  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192151  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0121  PaREP1 family protein  38.51 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0163  PaREP1 domain-containing protein  43.59 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0566  PaREP1 domain-containing protein  44.09 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1267  PaREP1 domain-containing protein  43.15 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.852254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0873  PaREP1 domain-containing protein  42.21 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1095  PaREP1 domain-containing protein  39.47 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.220858 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1416  PaREP1 domain-containing protein  42 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1348  PaREP1 domain-containing protein  40.91 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1132  PaREP1 domain-containing protein  39.29 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.252197  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0223  PaREP1 domain-containing protein  45.22 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.986183  normal  0.345709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0282  PaREP1 domain-containing protein  41.13 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1373  PaREP1 domain-containing protein  37.75 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.550442 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1300  PaREP1 domain-containing protein  35.95 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0833015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0950  PaREP1 domain-containing protein  39.23 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  0.692047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0934  PaREP1 domain-containing protein  37.69 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000142173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>