45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2789 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  68.98 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  54.38 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  53.47 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  51.07 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  49.7 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  49.85 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  53.78 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  49.85 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  50.3 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  48.79 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  50.15 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  49.39 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  50.61 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  47.58 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  48.18 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  48.18 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  47.88 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  46.67 
 
 		 333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  50.3 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  50.3 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  49.39 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  48.74 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  45.76 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  47.9 
 
 		 340 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  38.35 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  38.58 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  38.38 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  34.06 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  31.91 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  34.52 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  39.47 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  35.74 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  34.87 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  35.74 
 
 		 348 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  34.74 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.84 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  33.21 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  34.43 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  34.97 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  31.23 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  32.36 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  27.95 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>