43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0697 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  100 
 
 		 344 aa  713    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  47.79 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  47.79 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  46.88 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  46.78 
 
 		 344 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  47.73 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  47.73 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  41.72 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  40 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  38.87 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  43.23 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  40 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  39.7 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  39.81 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  38.2 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  39.69 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  36.53 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  38.01 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  34.63 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  36.73 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  34.41 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  35.22 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  38.05 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  36.15 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  36.15 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  34.81 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  35.33 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  35.83 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  34.51 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  33.62 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  33.43 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  34.34 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  29.62 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  30.33 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  29.33 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  29.57 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  30.21 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  29.05 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  29.05 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  27.07 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  24.84 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  24.76 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1421  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>