18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0613 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0613  yecA family protein  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01596  yecA family protein  36.11 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  26.32 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  31.43 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  27.34 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  29.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  28.85 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  28.85 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  28.85 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>