9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2214 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  124  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  80 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  56 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  84.62 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  68 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  38.78 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  31.48 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  32.81 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>