16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2396 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  100 
 
 		 377 aa  781    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  72.31 
 
 		 366 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  64.3 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  63.64 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  61.08 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  62.4 
 
 		 378 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  61.46 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  55.79 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  55.79 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  35.88 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  34.49 
 
 		 383 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  31.8 
 
 		 410 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  35.37 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  46.34 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  33 
 
 		 757 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  32.1 
 
 		 710 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>