16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5414 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5414  lipoprotein, putative  100 
 
 		 338 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5202  hypothetical protein  29.22 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4273  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194674  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2203  hypothetical protein  23.14 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  30.94 
 
 		 1200 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  30.94 
 
 		 1200 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5564  hypothetical protein  25.86 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  27.07 
 
 		 693 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.71 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  34.29 
 
 		 985 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  32.58 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.17 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.21 
 
 		 1044 aa  43.1  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.17 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1493 aa  43.1  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>