12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4546 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4224  hypothetical protein  82.28 
 
 		 79 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  36.84 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  30.14 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  31.82 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  40.82 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>