28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2872 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  100 
 
 		 899 aa  1846    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  97.11 
 
 		 899 aa  1802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  43.17 
 
 		 910 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  41.96 
 
 		 888 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  40.24 
 
 		 881 aa  595  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  38.4 
 
 		 893 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  32.82 
 
 		 878 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  31.32 
 
 		 901 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  30.03 
 
 		 846 aa  330  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  39.17 
 
 		 832 aa  304  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  29.16 
 
 		 892 aa  300  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  37.37 
 
 		 820 aa  296  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  28.99 
 
 		 862 aa  294  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  37.45 
 
 		 844 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  35.65 
 
 		 815 aa  281  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  32.9 
 
 		 890 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  29.06 
 
 		 679 aa  246  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  28.93 
 
 		 674 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  23.61 
 
 		 938 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  27.61 
 
 		 835 aa  197  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  26.26 
 
 		 743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  24.04 
 
 		 726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  26.6 
 
 		 714 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  26.11 
 
 		 714 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  25.62 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  26.11 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  25.86 
 
 		 714 aa  119  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  38.51 
 
 		 185 aa  97.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>