21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2870 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1034    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  89.69 
 
 		 451 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  39.88 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4240  hypothetical protein  37.2 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0163273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  36.86 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  32.18 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  31.97 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  34.61 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  31.71 
 
 		 402 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  29.84 
 
 		 442 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1882  putative virulence effector protein  35.07 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 524 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.378193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  39.29 
 
 		 465 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  34.25 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  34.25 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  33.91 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  28.65 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  28.65 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  28.88 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  26.95 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  28.46 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>