29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0914 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  83.33 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1141  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.42 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3295  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.37 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0900  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.56 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1316  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  30.95 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  35.21 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04746  stas domain, putative  33.33 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.24 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.06 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.06 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  29.76 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  27.06 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2319  anti-anti-sigma factor, putative  34.09 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.06 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2429  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.11 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  27.06 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.06 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 		 108 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>