22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4561 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  93.53 
 
 		 139 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  62.32 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  54.35 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  57.97 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  57.97 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1205  hypothetical protein  57.25 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  58.02 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36840  hypothetical protein  63.04 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.693285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  43.06 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  35.45 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  36.21 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  33.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  30.99 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  32.28 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  41.1 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  36.76 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>