10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2436 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  100 
 
 
130 aa  265  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  70 
 
 
299 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  50 
 
 
278 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  48.7 
 
 
283 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  48.72 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  47.83 
 
 
283 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  47.83 
 
 
283 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  47.01 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  46.67 
 
 
287 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  44.92 
 
 
290 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>