42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0357 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  100 
 
 
342 aa  703    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  80 
 
 
340 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  80 
 
 
340 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  46.88 
 
 
344 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  47.66 
 
 
341 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  47.66 
 
 
341 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  43.93 
 
 
344 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  45.4 
 
 
339 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  43.04 
 
 
335 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  41.76 
 
 
344 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  42.19 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  41.09 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  41.69 
 
 
338 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  40.06 
 
 
341 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  40.38 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  43.12 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  40.06 
 
 
339 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  39.94 
 
 
351 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  37.76 
 
 
338 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  40.98 
 
 
352 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  39.63 
 
 
352 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  40 
 
 
352 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  41.46 
 
 
334 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  39.87 
 
 
353 aa  222  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  39.69 
 
 
375 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  37.96 
 
 
357 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  37.65 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  36.68 
 
 
364 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  34.18 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  34.6 
 
 
351 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  35.18 
 
 
386 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  34.12 
 
 
347 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  36.04 
 
 
336 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  33.02 
 
 
343 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  31.09 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  31.64 
 
 
340 aa  146  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  31.47 
 
 
342 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  31.73 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  30.15 
 
 
340 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  30.15 
 
 
340 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  29.57 
 
 
390 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  27.19 
 
 
334 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>