More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2563 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 923 aa  1869    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  88.41 
 
 		 923 aa  1640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  96.86 
 
 		 923 aa  1769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 1084 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.07 
 
 		 1336 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.81 
 
 		 6676 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.92 
 
 		 8646 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  31.41 
 
 		 2752 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.88 
 
 		 6889 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.68 
 
 		 2370 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.81 
 
 		 13537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  33.63 
 
 		 4383 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.75 
 
 		 4531 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  36 
 
 		 1110 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.05 
 
 		 5926 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00170  aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, putative  31.11 
 
 		 1409 aa  282  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.682323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.23 
 
 		 5929 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.38 
 
 		 4968 aa  280  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  29.65 
 
 		 1421 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.98 
 
 		 2385 aa  279  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.92 
 
 		 5953 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.54 
 
 		 2386 aa  279  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.15 
 
 		 2156 aa  279  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.54 
 
 		 1556 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.92 
 
 		 2156 aa  278  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  31.03 
 
 		 1394 aa  278  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 		 1336 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.64 
 
 		 2385 aa  277  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  31.38 
 
 		 2164 aa  277  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.7 
 
 		 1556 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.85 
 
 		 2581 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 		 1833 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.86 
 
 		 4960 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.99 
 
 		 2385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.99 
 
 		 2385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.34 
 
 		 2385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.34 
 
 		 2385 aa  275  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 		 4196 aa  275  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.35 
 
 		 3308 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.99 
 
 		 2385 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.9 
 
 		 1518 aa  274  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  35.24 
 
 		 3231 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  35.24 
 
 		 3231 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.98 
 
 		 4960 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 8914 aa  273  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.9 
 
 		 1518 aa  272  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.9 
 
 		 3498 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.59 
 
 		 2385 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.29 
 
 		 2156 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  35.21 
 
 		 3221 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.59 
 
 		 2385 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.86 
 
 		 5596 aa  271  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  32.79 
 
 		 1466 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.46 
 
 		 3086 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.91 
 
 		 2571 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.91 
 
 		 2571 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  30.27 
 
 		 1284 aa  270  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  32.51 
 
 		 1345 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 		 1816 aa  270  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.21 
 
 		 3219 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 		 3432 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.86 
 
 		 5372 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.82 
 
 		 1870 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 		 1466 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 		 1525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 		 2386 aa  267  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  32.98 
 
 		 2883 aa  266  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  32.71 
 
 		 8915 aa  266  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.65 
 
 		 3291 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 		 3710 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 		 9175 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.46 
 
 		 3086 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  34.91 
 
 		 3227 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 		 2273 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 		 2614 aa  265  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  33.85 
 
 		 4572 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  32.07 
 
 		 1383 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.14 
 
 		 1870 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  30.27 
 
 		 2508 aa  265  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.81 
 
 		 9498 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.28 
 
 		 5469 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.3 
 
 		 6661 aa  265  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  33.57 
 
 		 3650 aa  265  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  32.63 
 
 		 1093 aa  264  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.14 
 
 		 4882 aa  264  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  31.94 
 
 		 1528 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  31.94 
 
 		 1520 aa  264  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  31.94 
 
 		 1483 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  31.94 
 
 		 1483 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.11 
 
 		 6081 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  31.58 
 
 		 1525 aa  264  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.39 
 
 		 4489 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.84 
 
 		 4991 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.8 
 
 		 4318 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  31.17 
 
 		 1518 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 		 3227 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.77 
 
 		 3291 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  32.51 
 
 		 3165 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.5 
 
 		 6072 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>