15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0512 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  98.73 
 
 		 158 aa  313  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  93.33 
 
 		 150 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  82 
 
 		 150 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  62.42 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  77.57 
 
 		 154 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  73.15 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  52.2 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 152 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  47.37 
 
 		 147 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  46.43 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  30.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  29.51 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  28.69 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
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