210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0732 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  96.9 
 
 
324 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  75.4 
 
 
313 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  75.08 
 
 
313 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  75.08 
 
 
313 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  73.23 
 
 
327 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  70.32 
 
 
331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  47.13 
 
 
318 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  45.19 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  45.19 
 
 
321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  44.55 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  44.73 
 
 
324 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  44.09 
 
 
329 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  42.04 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  42.99 
 
 
334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  38.87 
 
 
356 aa  238  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  36.65 
 
 
360 aa  222  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  36.02 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  38.51 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  38.01 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  37.58 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2057  hypothetical protein  39.13 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.647616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  34.94 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  36.84 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  33.13 
 
 
316 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  33.13 
 
 
316 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3275  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000743183  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2523  protein of unknown function DUF403  33.96 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2906  hypothetical protein  33.96 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  32.2 
 
 
316 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  37.16 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  37.16 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  36.15 
 
 
313 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  36.15 
 
 
313 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3760  hypothetical protein  35.28 
 
 
319 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.198455  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  36.82 
 
 
313 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  36.15 
 
 
313 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  35.84 
 
 
313 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  35.02 
 
 
315 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  38.19 
 
 
313 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  34.29 
 
 
313 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  35.47 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  35.81 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  35.81 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1675  protein of unknown function DUF403  36.6 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  34.67 
 
 
333 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3100  hypothetical protein  34.92 
 
 
312 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.154956  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  32.99 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2255  protein of unknown function DUF403  34.82 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000569022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  35.47 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  33.88 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  34.2 
 
 
322 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  32.7 
 
 
313 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3414  hypothetical protein  33.23 
 
 
314 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  37.98 
 
 
315 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1013  protein of unknown function DUF403  34.38 
 
 
312 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  32.77 
 
 
313 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  35.69 
 
 
313 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  33.12 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  35.13 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  34.29 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3319  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846078  normal  0.720686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0307  hypothetical protein  33.54 
 
 
310 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.435724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  33.12 
 
 
315 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  33.11 
 
 
315 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  32.82 
 
 
325 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  34.47 
 
 
317 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  35.83 
 
 
313 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  33.86 
 
 
314 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  34.68 
 
 
345 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  33.86 
 
 
314 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2049  protein of unknown function DUF403  35.84 
 
 
331 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0774  hypothetical protein  33.86 
 
 
311 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0398  hypothetical protein  31.65 
 
 
332 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  33.12 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  34.42 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  32.08 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3034  hypothetical protein  34.47 
 
 
312 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  33.22 
 
 
320 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  34.59 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  33.02 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  33.23 
 
 
324 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  31.8 
 
 
319 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  34.28 
 
 
316 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  34.28 
 
 
316 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  32.7 
 
 
314 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  31.96 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  33.02 
 
 
317 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  33.02 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  33.65 
 
 
314 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  31.89 
 
 
322 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  32.19 
 
 
314 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  31.45 
 
 
316 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  31.25 
 
 
319 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>