26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52735 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52735  SIN3 binding protein  100 
 
 
591 aa  1213    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0582833  normal  0.0303882 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28271  Rac GTPase-activating protein BCR/ABR  22.36 
 
 
710 aa  72.8  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.692213  normal  0.257016 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.23 
 
 
1018 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07189  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  21.45 
 
 
697 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06173  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  20.21 
 
 
772 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01490  hypothetical protein  24 
 
 
876 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03385  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.74 
 
 
509 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560023 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08426  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  21.91 
 
 
765 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581444  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03683  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  19.15 
 
 
830 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.572773  normal  0.42744 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11228  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  19.4 
 
 
596 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10463  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  21.23 
 
 
683 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65252  putative transcriptional regulatory protein  21.41 
 
 
674 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.361708 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01402  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.34 
 
 
692 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000858732  hitchhiker  0.00000000000000641289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_10913  Fungal specific transcription factor  22.37 
 
 
643 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0760081  normal  0.897103 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04785  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  19.8 
 
 
687 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0132747  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07507  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  20.04 
 
 
748 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02430  hypothetical protein  29.17 
 
 
902 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08447  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  20.73 
 
 
620 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.764569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24 
 
 
825 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30683  predicted protein  23.14 
 
 
633 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.562242  normal  0.0808418 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08345  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
683 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00742  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.02 
 
 
791 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489626  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00110  conserved hypothetical protein  48.84 
 
 
728 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.441864  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02870  nucleus protein, putative  37.93 
 
 
837 aa  43.9  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01183  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.28 
 
 
698 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02700  hypothetical protein  35.71 
 
 
582 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.289743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>