34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43496 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43496  predicted protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01970  50S ribosomal protein L24 (AFU_orthologue; AFUA_4G10740)  35 
 
 		 203 aa  92.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000553302  hitchhiker  0.00696357 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31348  Putative mitochondrial ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0815  50S ribosomal protein L28P  42.03 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00548085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  34.18 
 
 		 96 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  41.27 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0222  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 94 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0077  50S ribosomal protein L28  33.77 
 
 		 98 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2326  50S ribosomal protein L28  32.95 
 
 		 97 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.972077  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11953  predicted protein  35.62 
 
 		 89 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  38.81 
 
 		 95 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 99 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0494  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 101 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  31.17 
 
 		 96 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  31.17 
 
 		 96 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2196  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472947  normal  0.335453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3302  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592148  normal  0.0516815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  35.38 
 
 		 96 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_004310  BR2015  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 97 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3586  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 99 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0406  50S ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 97 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.624837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  34.25 
 
 		 98 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2702  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 100 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.645172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 91 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0543  50S ribosomal protein L28  31.76 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4518  50S ribosomal protein L28  39.62 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4041  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 96 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1939  50S ribosomal protein L28  35.38 
 
 		 97 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 98 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3667  50S ribosomal protein L28  37.74 
 
 		 96 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.817393  hitchhiker  0.00205217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3424  50S ribosomal protein L28  33.85 
 
 		 96 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0875436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2290  50S ribosomal protein L28P  33.33 
 
 		 94 aa  42.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.798347 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0321  ribosomal protein L28  36.21 
 
 		 102 aa  42.4  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>