12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29775 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29775  predicted protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00070  conserved hypothetical protein  41.95 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531908  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06190  hypothetical protein  30.87 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  26.06 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  31.48 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  28.97 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  27.92 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.63 
 
 
482 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  27 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  33.71 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  31.48 
 
 
173 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>