74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46818 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  100 
 
 		 404 aa  845    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  30.41 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  35 
 
 		 256 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.22 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  32.35 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  36.43 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  34.13 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  37 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  29.02 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.38 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  33.74 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  29.81 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  40.23 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  42.7 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  38.89 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02817  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  38.04 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  28.86 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.76 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  39.02 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  38.1 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  34.21 
 
 		 301 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.64 
 
 		 229 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.64 
 
 		 229 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.84 
 
 		 229 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  30.61 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  29.59 
 
 		 312 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  32.89 
 
 		 300 aa  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.89 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  41.98 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.1 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.89 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  32.89 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.26 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  40.51 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.89 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  40.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  29.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  29.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  29.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  29.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  29.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  40.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  40.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  40.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  28.26 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  40.51 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.58 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.26 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  32.89 
 
 		 300 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.71 
 
 		 228 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.58 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.17 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  28.38 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44505  predicted protein  30.7 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.55 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  27.17 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.28 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  27.55 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0440547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.17 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.17 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.35 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.95 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  28.93 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.95 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.26 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.95 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.13 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>