81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44132 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  100 
 
 
386 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  32.35 
 
 
254 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  28.34 
 
 
322 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  27.75 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.02 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.29 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.46 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  27.54 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  27.57 
 
 
300 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.34 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.1 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.01 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  27.31 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  26.09 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  34.85 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  26.76 
 
 
299 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.85 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  26.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  26.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  26.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  26.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  26.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.12 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  26.32 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  30.17 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.32 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  27.75 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.74 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  28.86 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  23.78 
 
 
239 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.82 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  23.37 
 
 
239 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.12 
 
 
299 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.31 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.85 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  29.82 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  23.89 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.12 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.12 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  25.12 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5927  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.47 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0104695  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.98 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.98 
 
 
301 aa  59.7  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35118  predicted protein  26.18 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.36 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.7 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.38 
 
 
299 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  26.9 
 
 
312 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.38 
 
 
299 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.3 
 
 
256 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.68 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.38 
 
 
299 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  27.68 
 
 
311 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.12 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.68 
 
 
311 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.47 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  24.65 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.32 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  25.14 
 
 
304 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  23.83 
 
 
312 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.1 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  28.1 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  23.36 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.5 
 
 
300 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  26.67 
 
 
300 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.97 
 
 
300 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  25.44 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  25.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  25.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  25.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  25.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  25.44 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  26.25 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  27.27 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  26.83 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  26.83 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  26.83 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  26.83 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  26.83 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  26.95 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>