22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54751 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_54751  predicted protein  100 
 
 
742 aa  1524    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05470  VpsA, putative  45.22 
 
 
694 aa  628  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08023  Putative uncharacterized proteinVpsA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X230]  44.47 
 
 
696 aa  608  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0172951 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08874  dynamin-like GTPase Dnm1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02840)  41.06 
 
 
794 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362434  hitchhiker  0.000218966 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73603  predicted protein  43.13 
 
 
693 aa  581  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163855  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01680  dynamin protein dnm1, putative  49.73 
 
 
832 aa  526  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29756  predicted protein  46.59 
 
 
822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500789  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29011  predicted protein  38.31 
 
 
703 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.453341  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01093  mitochondrial dynamin GTPase (Msp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11970)  34.74 
 
 
909 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  35.67 
 
 
856 aa  169  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05070  dynamin GTPase, putative  35.52 
 
 
933 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05327  conserved hypothetical protein  30.27 
 
 
739 aa  121  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10691  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11890)  29.81 
 
 
735 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.999166 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01309  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G08580)  27.22 
 
 
717 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14771  predicted protein  28.95 
 
 
285 aa  98.2  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229039  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33467  predicted protein  28.18 
 
 
853 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.24736  normal  0.0311419 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01912  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07630)  23.02 
 
 
829 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0996086 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01648  conserved hypothetical protein  34.08 
 
 
417 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31402  predicted protein  27.7 
 
 
900 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0818576  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  28.44 
 
 
815 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00534  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 
191 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01322  dynamin family GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14300)  23.25 
 
 
743 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>