11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47562 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47562  predicted protein  100 
 
 
541 aa  1092    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47544  predicted protein  46.15 
 
 
935 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  41.9 
 
 
744 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  29.51 
 
 
755 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  22.41 
 
 
854 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48002  predicted protein  35.44 
 
 
2001 aa  51.2  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46405  predicted protein  39.08 
 
 
813 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  49.21 
 
 
479 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.55 
 
 
1000 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47657  predicted protein  40.34 
 
 
583 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47701  predicted protein  38.96 
 
 
795 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>