20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43556 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43556  predicted protein  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3619  hypothetical protein  39.34 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0114  hypothetical protein  39.1 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15591  hypothetical protein  39.74 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.734743 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07401  hypothetical protein  39.1 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0146348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1090  hypothetical protein  39.61 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.879899  decreased coverage  0.000000796571 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07951  hypothetical protein  39.87 
 
 
272 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.207074  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1452  hypothetical protein  39.49 
 
 
256 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0680  hypothetical protein  38.46 
 
 
265 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07331  hypothetical protein  37.82 
 
 
265 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0910  hypothetical protein  38.93 
 
 
277 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729442  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07351  hypothetical protein  37.82 
 
 
265 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07531  hypothetical protein  37.82 
 
 
265 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.747432  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1048  hypothetical protein  38.46 
 
 
269 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0668603  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_9675  predicted protein  51.09 
 
 
88 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.199231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0158  hypothetical protein  37.86 
 
 
269 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0477  hypothetical protein  37.86 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1313  hypothetical protein  34.64 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1341  hypothetical protein  34.64 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4510  hypothetical protein  35.14 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>