17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42429 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42429  predicted protein  100 
 
 		 625 aa  1314    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  35.41 
 
 		 578 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  31.42 
 
 		 744 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  30.67 
 
 		 675 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43289  predicted protein  25.75 
 
 		 401 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43396  predicted protein  25.75 
 
 		 401 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37444  predicted protein  27.25 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00833047  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37824  predicted protein  27.17 
 
 		 304 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45096  predicted protein  25.73 
 
 		 765 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26290  predicted protein  23.78 
 
 		 349 aa  96.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55298  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (Cytoplasmic deadenylase) (Carbon catabolite repressor protein 4)  25.98 
 
 		 369 aa  93.2  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00447743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02360  expressed protein  26.25 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  26.83 
 
 		 808 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3023  predicted protein  24.47 
 
 		 335 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 		 271 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44427  predicted protein  26.49 
 
 		 311 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35882  RNA exonuclease NGL2 (Carbon catabolite repressor protein 4 homolog)  20.71 
 
 		 463 aa  44.3  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>