15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36608 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36608  predicted protein  100 
 
 
347 aa  713    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.236222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  33.03 
 
 
195 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  29.89 
 
 
191 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  36.67 
 
 
183 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  24.87 
 
 
186 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  43.08 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  24.62 
 
 
188 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  36.11 
 
 
188 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  35 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  23.12 
 
 
186 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  21.71 
 
 
183 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  26 
 
 
196 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  32.2 
 
 
183 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  22.84 
 
 
186 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  36.67 
 
 
200 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>