15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34794 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34794  predicted protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.855595  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04620  endoplasmic reticulum protein, putative  32.45 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.509018  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01522  DUF962 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05310)  30.56 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1250  hypothetical protein  25.65 
 
 
181 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00054551  hitchhiker  0.00000187464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0198  hypothetical protein  23.37 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4482  protein of unknown function DUF962  26.92 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4616  protein of unknown function DUF962  26.92 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44311  hypothetical membrane protein  23.04 
 
 
191 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.281125  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02639  hypothetical protein  25.4 
 
 
171 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0352  hypothetical protein  25.67 
 
 
182 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0312  hypothetical protein  23.91 
 
 
174 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4880  hypothetical protein  27.87 
 
 
180 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0026  hypothetical protein  26.6 
 
 
179 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2666  hypothetical protein  29.51 
 
 
178 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0525575  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4121  hypothetical protein  25 
 
 
181 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>