15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34392 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34392  predicted protein  100 
 
 
219 aa  464  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736354  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40699  predicted protein  46.43 
 
 
120 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.323307  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03960  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1760  NADH dehydrogenase  42.65 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  0.0708647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3032  NADH dehydrogenase  36.23 
 
 
136 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2699  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
136 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0192711  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02260  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06540)  38.33 
 
 
136 aa  45.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.634001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1809  NADH dehydrogenase  39.44 
 
 
145 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2418  NADH dehydrogenase  34.78 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211184  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0528  hypothetical protein  40.32 
 
 
103 aa  43.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4231  NADH dehydrogenase  37.31 
 
 
136 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1531  NADH dehydrogenase  39.13 
 
 
132 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91354  normal  0.684838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2555  NADH dehydrogenase  38.6 
 
 
127 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1036  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  31.17 
 
 
138 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6039  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  34.67 
 
 
138 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0258957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>