30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1979 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  98.14 
 
 
1078 aa  2167    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3979  Lanthionine synthetase C family protein  37.07 
 
 
1117 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.027595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 
1078 aa  2203    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2897  Lanthionine synthetase C family protein  36.47 
 
 
1126 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.965177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5238  Lanthionine synthetase C family protein  35.34 
 
 
1129 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3047  Lanthionine synthetase C family protein  35.82 
 
 
1088 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.318736 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  31.13 
 
 
1058 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0783  Lanthionine synthetase C family protein  25.2 
 
 
1074 aa  344  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265394  normal  0.258057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1868  lanthionine synthetase C family protein  27.21 
 
 
1080 aa  323  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3486  Lanthionine synthetase C family protein  26.18 
 
 
1093 aa  314  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0546748  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21071  MrsD-like protein  27.09 
 
 
1068 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.365739 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1243  lanthionine synthetase (lantibiotic biosynthesis)  26.76 
 
 
989 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1107  Lanthionine synthetase C family protein  24.92 
 
 
1040 aa  254  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0940946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0349  lanthionine synthetase C family protein  24.26 
 
 
996 aa  214  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3731  Lanthionine synthetase C family protein  22.27 
 
 
1012 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.760247 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6089  lanthionine synthetase C family protein  24.26 
 
 
973 aa  169  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1651  lantibiotic modifying enzyme  20.38 
 
 
1033 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3738  lanthionine synthetase C-like  26.64 
 
 
611 aa  149  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4441  Lanthionine synthetase C family protein  22.87 
 
 
959 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5313  Lanthionine synthetase C family protein  22.95 
 
 
1013 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0569792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4908  putative lantibiotic modification protein  23.95 
 
 
568 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1493  Lanthionine synthetase C family protein  29.06 
 
 
437 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.126791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  26.55 
 
 
661 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5326  Lanthionine synthetase C family protein  24.79 
 
 
614 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
713 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4031  Lantibiotic modifying protein-like protein  23.64 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304632  normal  0.0724238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 
865 aa  58.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09700  lantibiotic modifying enzyme  21.08 
 
 
610 aa  56.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
880 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 
861 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>