More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0013 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0039  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2885 bp  5717    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0021  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 		 2873 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380861  normal  0.0691187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0013  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2885 bp  5719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0022  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 		 2873 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0028  23S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 2826 bp  1457    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.216224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0015  23S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 2826 bp  1457    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0330933  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  88.97 
 
 		 2876 bp  1328    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0009  23S ribosomal RNA  92.01 
 
 		 2812 bp  1558    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00993914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0027  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2885 bp  5703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.877098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0040  23S ribosomal RNA  92.01 
 
 		 2812 bp  1558    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0789555  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0043  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 		 2873 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0044  23S ribosomal RNA  89.76 
 
 		 2873 bp  3277    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223039  normal  0.259444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0037  23S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 2826 bp  1457    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0009  23S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 2826 bp  1457    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.214919  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 2875 bp  1443    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0039  23S ribosomal RNA  88.97 
 
 		 2875 bp  1334    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0009  23S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 2830 bp  1471    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.349065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0023  23S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 2830 bp  1471    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00726109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0038  23S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 2830 bp  1471    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0050  23S ribosomal RNA  89.94 
 
 		 2830 bp  1471    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0047  23S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 2866 bp  1461    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0050  23S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 2866 bp  1461    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0019  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2866 bp  1374    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0048  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2866 bp  1374    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrlVIMSS1365722  23S ribosomal RNA  88.53 
 
 		 2876 bp  1281    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0012  23S ribosomal RNA  88.45 
 
 		 2874 bp  1273    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  86.8 
 
 		 2878 bp  2567    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  86.8 
 
 		 2878 bp  2567    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0017  23S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 2881 bp  2512    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00563866  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0026  23S ribosomal RNA  87.96 
 
 		 2881 bp  2512    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0380679  decreased coverage  0.000773701 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrlVIMSS1365720  23S ribosomal RNA  88.61 
 
 		 2874 bp  1289    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.576306  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrlVIMSS1365721  23S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 2874 bp  1296    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrlVIMSS1365723  23S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 2874 bp  1350    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365778  23S ribosomal RNA  89.32 
 
 		 2873 bp  1411    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2923 bp  555  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2922 bp  547  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2923 bp  547  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2923 bp  547  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2923 bp  547  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  87.5 
 
 		 2923 bp  547  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0004  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 3129 bp  541  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0055  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 3129 bp  541  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639179  decreased coverage  0.00060371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0027  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 3129 bp  541  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.344785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0017  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 		 3129 bp  541  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2933 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2932 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 2935 bp  523  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0077  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0051  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0048  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0093  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0066  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0027  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0004  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2928 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0060  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.129555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0032  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0004  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0024  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0070  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0037  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0010  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0113  23S ribosomal RNA  86.79 
 
 		 2927 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0017  23S ribosomal RNA  88.39 
 
 		 3592 bp  513  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2632 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1565  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2631 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1584  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2631 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1619  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2631 bp  511  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.20169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  86.61 
 
 		 2909 bp  507  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  86.48 
 
 		 2631 bp  504  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  86.48 
 
 		 2631 bp  504  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0015  23S ribosomal RNA  86.62 
 
 		 2972 bp  502  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.544354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 3529 bp  502  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 3088 bp  502  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  86.17 
 
 		 3260 bp  502  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2909 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2908 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2911 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2911 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2911 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2911 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  86.43 
 
 		 2911 bp  500  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>