29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5856 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5856  transposase, putative  100 
 
 
110 aa  229  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  91.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  91.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  91.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  90.74 
 
 
292 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  90.74 
 
 
292 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5767  transposase, putative  100 
 
 
61 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  46.6 
 
 
119 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  46.6 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  46.6 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  46.6 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  46.6 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1311  hypothetical protein  46.08 
 
 
118 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1044  hypothetical protein  65.85 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2397  hypothetical protein  45.21 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.681747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2958  putative transposase  52.27 
 
 
44 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0180771  normal  0.0609062 
 
 
-
 
NC_002978  WD1069  hypothetical protein  52.5 
 
 
50 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.510963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.89 
 
 
262 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  29.89 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  34.12 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  51.35 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3967  putative transposase of insertion sequence ISRm2011-2, orfA protein  31.88 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>