18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2958 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2958  putative transposase  100 
 
 
44 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0180771  normal  0.0609062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  79.07 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  76.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  76.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  76.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  76.74 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5767  transposase, putative  52.27 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5856  transposase, putative  52.27 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  53.49 
 
 
292 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  53.49 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  53.49 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  53.49 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  53.49 
 
 
292 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1311  hypothetical protein  47.73 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1069  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.510963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  50 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2397  hypothetical protein  48.78 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.681747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  47.22 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>