15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3905 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3905  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5309  hypothetical protein  64.21 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3762  hypothetical protein  63.16 
 
 
113 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000079403  normal  0.0464919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2356  hypothetical protein  58.76 
 
 
112 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1363  hypothetical protein  47.42 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0675  hypothetical protein  53.09 
 
 
130 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0901  hypothetical protein  53.42 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1941  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4521  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000119518  normal  0.999425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6242  hypothetical protein  44.26 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166665  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0868  hypothetical protein  38.1 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.213532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3727  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4376  hypothetical protein  36.71 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000005005  unclonable  0.00000000143863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4314  hypothetical protein  37.97 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0522  hypothetical protein  34.52 
 
 
121 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0123938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>