29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3904 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3761  hypothetical protein  55.14 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000832493  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5308  protein of unknown function DUF433  56.07 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2357  hypothetical protein  45.65 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.263343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  39 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  40.28 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2544  protein of unknown function DUF433  38.03 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4520  protein of unknown function DUF433  33.75 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000972805  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  33.93 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  35.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  32.26 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  42.5 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  35.71 
 
 		 76 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  33.93 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  32.14 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  33.87 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  32.14 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  32.31 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  32.31 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  31.03 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  32.31 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  37.29 
 
 		 78 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>