45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3589 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  100 
 
 
348 aa  708    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  68.82 
 
 
343 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  68.82 
 
 
343 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  60.47 
 
 
348 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  63.08 
 
 
348 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  56.14 
 
 
349 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  50.58 
 
 
360 aa  334  1e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  39.47 
 
 
340 aa  222  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  37.86 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  38.39 
 
 
337 aa  212  7e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  37.46 
 
 
363 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  36.28 
 
 
341 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  40.81 
 
 
335 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  40.57 
 
 
335 aa  185  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  34.51 
 
 
365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  34.4 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  36.18 
 
 
332 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  36.73 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  36.84 
 
 
331 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  35.49 
 
 
340 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  34.43 
 
 
337 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  34.87 
 
 
333 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  33.55 
 
 
340 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  34.52 
 
 
333 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  34.87 
 
 
333 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  34.19 
 
 
334 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  34.54 
 
 
333 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  35.4 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  34.86 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  33.01 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  34.8 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  33.96 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  32.39 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  34.8 
 
 
330 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  34.35 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  32.04 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  32.36 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  34.43 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  36.29 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  36.29 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  31.63 
 
 
353 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  31.72 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  28.18 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  26.77 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  29.03 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>