29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3206 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3206  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0460524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0726  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  48.78 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3027  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  41.98 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1324  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  41.43 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.179973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2884  transcriptional regulator  50.88 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579696  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5523  addiction module antidote family protein  34.62 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1735  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  36.11 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1046  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2088  transcriptional regulator  36.76 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0268696  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4222  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3093  helix-turn-helix protein, CopG  41.27 
 
 
84 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2652  hypothetical protein  32.47 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5298  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  39.68 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803296  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7136  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2938  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  45.61 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01196  helix-turn-helix protein, CopG  36.07 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6479  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3568  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.951393  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5432  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.42 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1511  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  41.18 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5158  CopG/Arc/MetJ family addiction module antidote protein  42.86 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2745  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  30.86 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2489  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  32.79 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.75624  normal  0.124302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2127  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114302  normal  0.153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0710  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  33.33 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0441596  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  37.31 
 
 
82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.330303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0490  putative addiction module antidote protein, CC2985 family  34.29 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0442  CC2985 family addiction module antidote protein  34.29 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6369  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  35.21 
 
 
82 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.547419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>