20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3617 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3617  NmrA family protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.392591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3806  NmrA family protein  88.35 
 
 		 309 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0801  putative isoflavone oxidoreductase  52.49 
 
 		 315 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2562  NmrA-like protein  53.82 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1077  isoflavone reductase  49.03 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1802  isoflavone reductase  53.51 
 
 		 309 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  0.0109972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1803  isoflavone reductase  53.54 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1472  isoflavone reductase  53.51 
 
 		 309 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1654  isoflavone reductase  53.51 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0467519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1864  isoflavone reductase  53.18 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0184  NmrA family protein  47.92 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6810  NmrA family protein  47.84 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4574  NmrA family protein  46.62 
 
 		 317 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4834  NmrA family protein  47.51 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2406  NmrA-like  47.84 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05317  NmrA-like family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00280)  38.11 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31822  predicted protein  28.32 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00205579  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09181  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  25.85 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  23 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32445  predicted protein  24.73 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>