27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2684 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2684  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2816  hypothetical protein  81.31 
 
 		 108 aa  190  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2904  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  80.37 
 
 		 108 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3617  hypothetical protein  34.02 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0370  hypothetical protein  32.65 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1020  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.73 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0532552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2874  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.67 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0353  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.96 
 
 		 233 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  0.260542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2680  hypothetical protein  32.56 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.566186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5960  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3492  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.43 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5271  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.57 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2876  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.29 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3830  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.070961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0350  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.3 
 
 		 231 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00348812  normal  0.491483 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3523  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  34.48 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3831  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.57 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3811  hypothetical protein  37.66 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00812123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3850  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.08 
 
 		 230 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4710  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7024  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.53 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211246  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0018  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 245 aa  41.6  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0812  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  27.47 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5384  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.62 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.506576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2840  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.65 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0362  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.96 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.620508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2091  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.17 
 
 		 227 aa  40  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  0.246638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>