25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3850 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3850  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4710  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  23.61 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1020  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.25 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0532552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2840  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  38.95 
 
 		 111 aa  62  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3492  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.38 
 
 		 111 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2874  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  25.35 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3831  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  28.3 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2530  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.69 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0362  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  23.65 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.620508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0353  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  21.26 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  0.260542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3617  hypothetical protein  31.53 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1862  hypothetical protein  27.64 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.530634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0823  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  22.03 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.104717  unclonable  0.00000965706 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5271  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.71 
 
 		 113 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2904  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.39 
 
 		 108 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.507407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2816  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2091  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.03 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2866  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  24.86 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2876  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3012  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  33.03 
 
 		 127 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5311  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  30.91 
 
 		 124 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2684  Ethyl tert-butyl ether degradation EthD  32.08 
 
 		 108 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0370  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 110 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3811  hypothetical protein  29.21 
 
 		 123 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00812123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>